次世代シーケンサー ライブラリ作製@バイオバンク

QIAGEN, QIAseq Targeted DNA Pro PanelsもしくはQIAGEN, QIAseq Fusion XP Targeted Panels

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概要

次世代シークエンサー用のライブラリを作製します。

装置の仕様・特色

現在対応可能なのは下記のキットになります。

・QIAseq Targeted DNA Pro Panels
特定の遺伝子領域または遺伝子パネルに焦点を当てたシーケンスターゲットパネルです。これらのパネルは、疾患関連の遺伝子変異、がん関連の変異、または他の興味深い遺伝子領域を含むことができ、専用の解析ソフトウェアやバイオインフォマティクスツールを使用して解析されます。これにより、遺伝子変異の特定や遺伝子発現の定量など、さまざまな解析が可能になります。高度な遺伝子解析において高い信頼性と再現性を提供する革新的なソリューションです。疾患研究、がん研究、遺伝性疾患のスクリーニングなど、さまざまな研究領域で利用されています。

詳しくは 製品サイト:https://tinyurl.com/2c6dcg3c

・QIAseq Fusion XP Targeted Panels
融合遺伝子の検出とSNV、そして遺伝子発現の組み合わせた分析を単一のサンプルから行うことができるため、研究に必要な複雑なRNA-seqの洞察を得ることができます。他の多くの融合検出システムは、これらの解析に要求される高感度のために高い偽陽性(FP)率を抱えています。しかし、QIAseq Fusion XP Targeted Panelsはその中でも優れた性能を発揮し、非常に低いFP率と高い融合検出感度を提供します。

詳しくは 製品サイト:https://tinyurl.com/2h4kyco4

★★★ご利用に関するご質問は下記よりお問い合わせください★★★
バイオバンクお問い合わせフォーム:https://biobank.ccsv.okayama-u.ac.jp/contact/

問い合わせ時は合わせて下記をご連絡ください
・サンプル数
・サンプルの種類 (DAN, RNA)
・対象疾患もしくは遺伝子名

謝辞掲載のお願い

本装置で得られたデータを外部に出版する際は、下記のとおり謝辞の記載をお願いいたします。

This work has been partly supported by Core-Facility at Okayama University(CFPOU OBB-010)
本研究はコアファシリティの支援を得て実施されました(CFPOU OBB-010)

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依頼測定 学内 学外 要利用資格
設置年 2014
CFPOU管理番号 OBB-010
機器種別
装置カテゴリ
適合分野 生物・医学・薬学系
管理部局 岡大バイオバンク
サポート職員

バイオバンク
電話:086-235-6029
問い合わせフォーム:https://tinyurl.com/2hwaurly

拠点

岡大バイオバンク

依頼測定について

分析内容

■対応するキット
・QIAGEN, QIAseq Targeted DNA Pro Panels
・QIAGEN, QIAseq Fusion XP Targeted Panels
*細菌叢解析、de novo assemblyは対象外

■対象サンプル
・核酸溶液 (DNA, RNA)

■サンプル数上限
・12サンプル
 ・QIAGEN, QIAseq Targeted DNA Pro Panels :最低 10 ng (FFPE 100 ng)
 ・QIAGEN, QIAseq Fusion XP Targeted Panels:最低 50 ng (FFPE 100 ng)

■サンプル以外に必要なもの
・サンプル一覧表(上記、サンプル数上限ごとにシートを分ける)
・使用するライブラリ作製キット

■事前の確認事項
・対象疾患に適したパネルであるか、もしくはパネルが希望する遺伝子を含んでいるか
・シークエンスする場合の、推奨される1サンプル当たりのデータ量

■提出方法
・病原性微生物を含んでいないことを確認
・各プロトコルの推奨濃度に調整したサンプルを上記容量に合わせて1.5 mLチューブに移す。
 *濃度の測定方法は、蛍光強度による測定が推奨。バイオバンクで測定可。
・上記サンプル一覧表で対応しているNo.をチューブ本体に記載する。
・チューブラックもしくはフリーズボックスに上記チューブを入れ、名前と所属がわかるようにする。
 *サンプル数が12カラム相当分を超える場合は、サンプル一覧表ごとに分けて提出する。
・事前連絡の上、バイオバンクへ提出する。

申込方法

注:下記の「依頼する」ボタンからは依頼できません。バイオバンクへ問い合わせフォームを通じて依頼してください。

お問い合わせフォーム:https://biobank.ccsv.okayama-u.ac.jp/contact/

依頼測定料金

別途、お問い合わせください。

申込用紙 biobank@okayama-u.ac.jp
依頼する